Prévoyance

Comment estimer le coût d'un arrêt maladie pour votre entreprise ?

7 min de lectureMis à jour en 2026
Rédigé par l'équipe Le Zèbre, relu par un expert en protection sociale.Le Zèbre — courtier en assurance santé & prévoyance · ORIAS n° 23006112

Le coût d'un arrêt maladie ne se résume pas au maintien de salaire.

Derrière une absence se cachent souvent des impacts moins visibles : remplacement du collaborateur, réorganisation des équipes, perte de productivité ou ralentissement de l'activité. Pourtant, ces coûts sont encore largement sous-estimés. Beaucoup d'entreprises évaluent uniquement les conséquences immédiates d'un arrêt maladie, sans mesurer son impact global sur leur organisation et leur trésorerie. Estimer le coût réel d'un arrêt maladie permet d'anticiper ces situations, de mieux piloter son entreprise et d'évaluer l'intérêt de dispositifs comme la prévoyance collective pour limiter les conséquences financières des absences de longue durée. Dans cet article, découvrez les éléments qui composent le coût d'un arrêt maladie et comment en réaliser une estimation fiable.

Le dictionnaire du Zèbre

Avant d'aller plus loin, commençons par parler le même langage.

Subrogation (n.f) : Mécanisme qui permet à l'employeur de continuer à verser le salaire du collaborateur pendant son arrêt maladie, tout en percevant directement les indemnités journalières de la Sécurité sociale (IJSS). Concrètement : le salarié continue de percevoir son salaire selon les règles applicables ; la Sécurité sociale verse les IJSS directement à l'employeur ; l'entreprise déduit ces indemnités du coût réel du maintien de salaire. La subrogation est le mode de fonctionnement le plus courant et constitue un élément essentiel pour estimer le coût réel d'un arrêt maladie.

IJSS (n.f) : Les IJSS sont les indemnités versées par la Sécurité sociale pour compenser une partie de la perte de rémunération d'un salarié en arrêt maladie. Dans la plupart des entreprises, elles interviennent dans le mécanisme de maintien de salaire. Lorsque l'employeur pratique la subrogation, il continue de verser le salaire au collaborateur puis perçoit directement les IJSS versées par la Sécurité sociale. Le montant des IJSS constitue donc l'un des éléments essentiels pour estimer le coût réel d'un arrêt maladie pour l'entreprise.

Ce que coûte vraiment un arrêt maladie

Un arrêt maladie ne génère pas une seule dépense… mais plusieurs. Lorsqu'un collaborateur est absent, le coût pour l'entreprise ne se limite pas au maintien de salaire. Plusieurs postes de dépenses viennent progressivement s'additionner, certains étant visibles immédiatement, d'autres beaucoup plus difficiles à mesurer.

Coûts visibles et coûts invisibles d'un arrêt maladie représentés en iceberg : maintien de salaire, IJSS et prévoyance au-dessus, remplacement, baisse de productivité et désorganisation en dessous

Comment fonctionne l'indemnisation d'un arrêt maladie ?

Lorsqu'un salarié est en arrêt maladie, sa rémunération peut provenir de plusieurs acteurs. Selon la durée de l'arrêt, les obligations légales, la convention collective et les garanties mises en place par l'entreprise, le maintien de salaire est assuré par différents dispositifs qui se complètent progressivement.

Les trois acteurs du maintien de salaire pendant un arrêt maladie : la Sécurité sociale via les IJSS, l'employeur en complément, la prévoyance collective si l'arrêt se prolonge

Comment calculer le coût direct du maintien de salaire

Formule de calcul du coût du maintien de salaire et exemple chiffré : salaire brut journalier, taux de maintien, IJSS versées à l'employeur en subrogation, puis coût net employeur

Les idées reçues

Quatre idées reçues sur le coût d'un arrêt maladie et la réalité en regard

Le diagnostic du Zèbre

Parce qu'une bonne décision commence toujours par les bonnes questions.

Vous connaissez désormais les principaux mécanismes qui influencent le coût d'un arrêt maladie. Mais chaque entreprise possède ses propres spécificités : rémunérations, conventions collectives, garanties de prévoyance ou encore organisation interne. Quelques questions peuvent vous aider à évaluer votre niveau de visibilité.

  • Quel est le coût réel d'un arrêt maladie de 15 ou 30 jours dans votre entreprise ?
  • Votre convention collective prévoit-elle un maintien de salaire plus favorable que le minimum légal ?
  • Quel reste à charge est réellement supporté après déduction des IJSS et de la prévoyance ?
  • Quel serait l'impact financier d'un arrêt de longue durée sur votre activité ?
  • Quels coûts indirects (remplacement, désorganisation, perte de productivité…) viennent s'ajouter au maintien de salaire ?

Si une ou plusieurs réponses vous paraissent incertaines… C'est peut-être le bon moment pour estimer concrètement l'impact financier d'un arrêt maladie dans votre entreprise. Notre simulateur vous aide à obtenir une première estimation personnalisée en quelques clics, afin de mieux anticiper vos coûts et éclairer vos décisions.

Estimer le coût d'un arrêt maladie avec le simulateur Le Zèbre

Vous souhaitez aller plus loin ?

Estimer le coût d'un arrêt maladie est une première étape. Pour mieux anticiper les risques et accompagner vos décisions, il est essentiel de disposer d'une vision globale de vos indicateurs RH. Allez plus loin dans votre pilotage grâce à une vision consolidée : identifiez les tendances, facilitez vos analyses et prenez des décisions fondées sur les données de votre entreprise.

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Le regard du Zèbre

On parle souvent du coût d'un arrêt maladie. Beaucoup plus rarement de ce qu'il raconte. Derrière chaque absence se cachent des enjeux humains, organisationnels et financiers qui méritent d'être analysés dans leur ensemble. Un chiffre, à lui seul, n'explique jamais une situation. C'est la compréhension de son contexte qui permet de prendre les bonnes décisions.

Chez Le Zèbre, nous croyons qu'une entreprise performante est avant tout une entreprise capable d'anticiper plutôt que de subir. Donner de la visibilité sur le coût d'un arrêt maladie, c'est offrir aux dirigeants les moyens d'agir plus tôt, de mieux protéger leurs équipes et de piloter leur activité avec davantage de sérénité.

« Parce qu'une entreprise avance mieux, elle comprend les risques qui façonnent son quotidien. »

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